Actualmente la Red cuenta con 10 Áreas Temáticas (AT) en diferentes etapas de desarrollo. Algunas ATs tienen sus propias páginas de Internet con información acerca de sus actividades, miembros y producción. Algunas ATs también tienen su propia Serie en los Cuadernos de Trabajo de la Red WATERLAT-GOBACIT, en la cual sus miembros y autores invitados publican sus trabajos en progreso. Las ATs también cuentan con su Lista de Reproducción en el Canal de Youtube de la Red, la cual contiene entrevistas con sus miembros, videos de sesiones organizadas en los eventos regulares de la Red, videos de actividades de investigación incluyendo entrevistas, visitas de campo, y otros materiales. La colección de fotografías de la Red en Flickr también contiene varios álbumes relacionados con actividades de las ATs, tanto específicas de cada AT o compartidas con otras ATs.
Área Temática (AT) 1 – La x-disciplinariedad en la Investigación y la Acción
Área Temática (AT) 2 – Agua y Megaproyectos
Área Temática (AT) 3 – El Ciclo Urbano del Agua y los Servicios Públicos Esenciales
Área Temática (AT) 4 – Aguas Transfronterizas
Área Temática (AT) 5 – Agua y Salud
Área Temática (AT) 6 – Cuencas, Territorios y Espacios Hidrosociales
Área Temática (AT) 7 – Arte, Comunicación, Cultura y Educación
Área Temática (AT) 8 – Desastres Relacionados con el Agua
Área Temática (AT) 9 – Agua y Producción
Área Temática (AT) 10 – Agua y Violencia